组织管理制度是整个制度体系的基础，目的在于明确分工，建立协调机制。组织管理制度主要内容是明确政府网站的领导机构、建设和管理单位、技术支撑单位、内容保障单位、保密审查单位等相关方；界定政府网站相关责任方的具体职责与要求；建立内部协调机制，实现统一规划、统一部署；提出政府网站管理机构的内部架构及对工作人员的具体岗位要求，建立持续发展的人员培训机制，政府网站工作人员具备必要的专业技术能力；建立政府网站群中门户网站与子站的上下联动机制，形成较好的指导与维护关系。
（二） 网站设计制度
本制度的目的在于规范网站设计和栏目调整。主要内容有网站页面和栏目设计和调整的职责分工；门户网站页面设计和信息公开、在线办事、公众参与栏目的新增、修改、删除的原则及实施的流程；子站页面设计和栏目调整的原则和实施流程；门户网站和子站共建栏目的调整原则和实施流程等。
（三） 信息发布制度
本制度的目的在于规范政府网站的信息发布。主要内容为明确信息发布的原则；界定信息公开的范围和详实的内容要求、信息发布的格式；规定信息采集、编辑、审核、发布、更新等各个工作环节的具体要求；明确各类信息的保障责任单位，建立信息统计制度；健全保密制度，防止信息泄密；加强信息资源的利用，为领导决策提供支持。
（四） 在线服务制度
本制度的目的在于保障在线服务和公众参与的有效性。主要内容包括明确在线服务的处理流程和具体的服务内容，规范办事事项的办理程序和服务方式；制定服务标准，明确在线服务的时间要求，服务指标、用户满意度等，保证事项按时保质完成；建立在线服务的使用帮助机制，方便用户办事；建立在线服务的持续改进机制，定期分析用户使用情况，不断丰富事项内容、改进服务质量。
（五） 互动参与制度
本制度的目的在于完善公众参与保障机制。主要内容有明确咨询投诉、意见征集、网上调查、在线访谈等互动渠道的保障责任，提出对各种渠道的具体保障要求。规范用户来信或留言的处理流程，建立处理答复机制；明确用户来信或留言的处理反馈时间，做到及时答复；规范用户来信或留言的答复质量要求，答复内容应准确、详细、无歧义；规范用户来信或留言的统计工作，定期分析、汇总用户反映的问题；根据工作重点和社会热点策划网上调查；制定在线访谈规划，定期开展访谈栏目。
该制度目的明确政府网站技术运维要求。从总体上看，技术运维制度主要包括系统硬件设备运维、系统基础软件运维、数据运维、系统监控等。制定系统硬件设备运维制度，明确确定支持网站运行的硬件设施的范围、硬件设备管理规范、各类硬件设施运行情况的统计分析、硬件设备管理和项目评估等要求；制定系统基础软件运维制度，明确支持网站运行的基础软件的范围、每类软件的软件包的管理、各类基础软件系统的日常管理规范、软件更新等要求；制定数据维护制度，明确数据存储、数据备份、数据交换、数据完整性与一致性、元数据管理等规范要求；制定系统监控制度，明确系统监控的范围和监控的流程，并可以考虑采用适宜的监控管理工具及安全防护工具以增强可管理性。界定运维人员的素质要求和职责；规范运维费用的批准和使用流程；提出运维外包的具体规定。
（七） 安全管理制度
参考国家信息安全等级保护管理规范和技术标准，确定网站安全保护等级，制定并落实符合本机构安全保护等级要求的安全管理制度，根据保护等级制定网站安全的管理策略，对突发安全事件制定应急预案和保障措施。建立由专业化的测评机构定期对信息系统安全等级状况开展测评的机制。明确应急响应预案，规范紧急情况下的事件处理流程、应急资源存放位置、人员联系方式、上报流程等。 建立定期演习和测试机制，保证应急预案有效。提出具体的安全管理要求，包括物理安全要求、网络安全要求、系统安全要求、信息安全要求等。
（八） 绩效考核制度
该制度的目的在于建立绩效考核机制，提升各子站及信息保障部门的工作积极性。主要内容有政府网站绩效考核工作的基本原则、组织分工；考核的对象范围；考核的具体内容；考核的时间周期及时间安排；绩效考核的方式；考核工作的实施规定，注重对考核过程的监控，对指标体系的制定、评分细则的优化、指标的意见征集、网站的整改和指导、开展网站自评估工作、网站数据的采集方式、绩效评估报告的编撰、绩效考核结果的发布等流程加强管理；尤其要强调网站日常监测的重要性，把日常监测和绩效考核有机结合起来；把绩效考核和网站培训结合起来，把绩效考核作为网站持续改进的重要手段。
（九） 监督投诉制度
监督投诉制度是政府网站制度体系的保障，保证其它制度能够落到实处。监督投诉制度的主要内容是明确政府网站监督投诉的内容范围和种类；监督投诉的具体途径；监督投诉的处理原则；监督投诉的处理流程；责任追究的内容范围和具体方式等。